A desaminação do glutamato é catalisada pela enzima glutamato desidrogenase, que utiliza FAD como coenzima e libera amônia (NH3) como produto.

A desaminação da glutamina ocorre em duas etapas: a primeira, catalisada pela glutaminase, libera amônia e glutamato; a segunda, catalisada pela glutamato desidrogenase, converte o glutamato em α-cetoglutarato e libera mais amônia.

A desaminação do glutamato e da glutamina ocorre exclusivamente no fígado, órgão responsável pela produção de ureia a partir da amônia.

A amônia produzida na desaminação do glutamato e da glutamina será utilizada para transaminações, por isso é fundamental para o animal e não é excretado.

A desaminação do glutamato e da glutamina é desestimulada em situações de jejum prolongado, quando a proteína muscular é degradada para fornecer aminoácidos como fonte de energia.