Os núcleos olivares, que correspondem as olivas tem relação com o aprendizado motor e tem conexões com o cerebelo.

Os núcleos ambíguos estão relacionados com a motricidade dos músculos da laringe e da faringe, e enviam fibras eferentes viscerais especiais através dos nervos VIII, IX, X, XI e XII.

O núcleo dorsal do vago está relacionado com o sistema parassimpáico, e ele forma a proeminência posterior denominada trigono do vago.

O núcleo salivatório inferior envia fibras pré-ganglionares que inervam a parótida através do nervo glossofaríngeo.

O núcleo do hipoglosso ocupa uma região que forma uma proeminência acima do trígono do vago denominada trígono do hipoglosso.