Para a maioria das doenças, amostras de sangue pós-prandial são as amostras de escolha.

Os aminoácidos livres em fluidos biológicos não sofrem interferência de fatores como estado nutricional e medicações.

A hemólise pode ser um interferente, reduzindo os níveis plasmáticos de glutamato e aspartato, por exemplo.

O líquido amniótico é utilizado na rotina para diagnóstico pré-natal das aminoacidopatias.

Alguns aminoácidos, como a glutamina, por exemplo, são instáveis e, por isso, as amostras devem ser transportadas e mantidas congeladas até que sejam analisadas.