Quanto maior a diferença em número atômico entre dois materiais, maior será o contraste dos números atômicos na imagem.

A topografia da imagem não pode ser apenas qualitativa pois a análise de detalhes da sombra não depende tanto das características da espécie analisada quanto da resposta do detetor do instrumento usado.

O coeficiente eletrônico de retroespalhamento não apresenta nenhuma dependência com a inclinação da superfície da amostra analisada.

Independente do detetor usado, a imagem sempre aparece com a máxima iluminação possível, mesmo com diferentes elementos químicos.

É muito difícil discernir imagens de microscopia eletrônica de varredura entre minerais contendo o mesmo ânion, como carbonato.