Em contato com a polpa, o hidróxido de cálcio promove uma desnaturação protéica superficial onde ficam limitados granulações de carbonato de cálcio resultante da reação do gás carbônico com o cálcio, estimulando o organismo a depositar imediatamente sais de cálcio e mais tarde a formação da barreira mineralizada, após o aparecimento de novos odontoblastos.

Em contato com os líquidos plasmáticos da polpa, ele libera íons de cálcio que se agrupam formando uma ponte dentinária devido à desnaturação protéica pela ação irritante do hidróxido de cálcio.

Em contato com a polpa radicular, a acidez do hidróxido de cálcio promove uma necrose profunda que estimula a formação da ponte dentinária e aparecimento de novos odontoblastos.

Em contato com a polpa radicular, o hidróxido de cálcio é encapsulado e seus íons livres formam a parte dentinária devido à reação com o gás carbônico existente na polpa.