Hiperploidia confere prognóstico desfavorável.

Presença da translocação t(9;22), atualmente, confere prognóstico favorável pela disponibilidade dos inibidores de tirosino-quinase.

Imunofenotipagem de medula óssea tem um papel definidor do diagnóstico, mas não do prognóstico.

Hiperleucocitose no diagnóstico é fator de risco para infiltração no sistema nervoso central.