Os aplicativos ou softwares dos autoanalisadores eliminam a necessidade de calibração periódica dos analitos que compõem o perfil desses equipamentos.

Falhas pré-analíticas, como hemólise e lipemia, podem ser corrigidas pelos autoanalisadores bioquímicos, com inserção de fatores no cálculo das determinações.

A produtividade média de autoanalisadores imunológicos, ou seja, o número de testes por hora, é superior a 500, independentemente da marca, modelo e metodologias empregadas.

O processamento aleatório ou randômico das amostras biológicas é um fator impeditivo para a execução de exames solicitados em caráter de urgência.

Alguns autoanalisadores bioquímicos, devido a características de seu aplicativo ou software, permitem a programação e utilização de reagentes de vários fabricantes para o mesmo analito.