interromper a polimerazação pela DNA polimerase na posição em que o dideoxinucleotídeo é pareado.

substituir os nucleotídeos originais da cadeia molde.

estimular a DNA polimerase a construir uma nova cadeia de DNA.

substituir os oligonucleotídeos iniciadores da reação em cadeia de polimerase.

separar as duas fitas da cadeia de DNA para permitir a polimerização da DNA polimeras.