Nos casos de biopulpectomia é indicado o desbridamento foraminal, com o objetivo de remover os restos orgânicos, microorganismos, toxinas e assim impedir que a lesão continue instalada.

O instrumento memória é pré-estabelecido e ajuda a formar o batente apical. O instrumento memória é utilizado a cada uso de instrumento maior, no mesmo comprimento desse instrumento que irá diminuir a cada etapa.

As substâncias irrigadoras são usadas na instrumentação com o objetivo de realizar a limpeza do canal, auxiliar na instrumentação, ser bactericida, entre outras funções. São utilizadas após o uso do instrumento apical inicial e após o uso do instrumento memória.

Em biopulpectomia o coto pulpar é o local apropriado para o tratamento endodôntico e localiza-se no canal cementário.

Após o preparo apical inicia-se o preparo escalonado, que é realizado diminuindo-se 1 mm de comprimento das limas e aumentando o seu diâmetro.