A Mata Atlântica, se considerada sua abrangência original, é o terceiro maior bioma do Brasil. É formada por um conjunto de formações florestais (florestas: ombrófila densa, ombrófila mista, estacional semidecidual, estacional deciduous e ombrófila aberta) e ecossistemas associados, como restingas, manguezais e campos de altitude. Esse bioma foi historicamente marcado pela devastação, estando localizado na principal área de crescimento urbano brasileiro desde o Período Colonial: o litoral. Hoje há uma tentativa de preservar os poucos remanescentes florestais que restaram, por meio da criação de unidades de conservação.

A Amazônia é o maior bioma da América do Sul e a maior reserva de biodiversidade do mundo. É um bioma dominado pelo clima quente e úmido (com temperatura média de 25 °C) e por florestas. Tem chuvas torrenciais bem distribuídas durante o ano e rios com fluxo intenso. A sua vegetação é marcada por grande diversidade de espécies e por vários estratos. Possui índices altos de degradação, pela ação de diversos fatores, como a expansão das fronteiras do agronegócio, a extração ilegal de madeira, entre outros.

A Caatinga é o quarto bioma brasileiro em extensão e é predominante na área abrangida pelo clima semiárido. É um bioma com alta biodiversidade e adaptado às condições climáticas adversas (escassez e incerteza hídrica, elevadas temperaturas, períodos de estiagem etc.). Possui vegetação de savana estépica, espinhosa e decidual (quando as folhas caem em determinada época). É um bioma exclusivamente brasileiro.

O bioma Pantanal está localizado na planície do Pantanal, que abrange os estados do Mato Grosso e Mato Grosso do Sul, e é caracterizado por inundações de longa duração (devido ao solo pouco permeável) que ocorrem anualmente na planície e provocam alterações no ambiente, na vida silvestre e no cotidiano das populações locais. A sua vegetação predominante é a savana.

O bioma Cerrado possui grande extensão territorial, sendo o segundo em extensão na América do Sul. Abrange os estados de Goiás, Tocantins, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerais, Bahia, Maranhão, Piauí, Rondônia, Paraná, São Paulo e Distrito Federal, além dos enclaves no Amapá, Roraima e Amazonas. É considerado um hotspot pelo alto grau de degradação que vem sofrendo, principalmente como resultado da expansão das fronteiras agrícolas nas regiões Centro-Oeste e Norte. Possui grande biodiversidade, com inúmeras espécies vegetais e animais, muitas delas endêmicas, e é berço de algumas bacias hidrográficas da América do Sul.