Na preparação do DNA para o sequenciamento, é desnecessária a ligação de adaptadores de DNA.

Na etapa inicial, as fitas simples de DNA se ligam randomicamente a superfície.

Para a amplificação, a enzima incorpora nucleotídeos para produzir uma dupla fita em ponte que realizada em um substrato sólido.

A etapa de desnaturação da dupla fita produzida deixa as fitas simples ancoradas no substrato.

A etapa de amplificação termina quando são formados milhões de agrupamentos de fita duplas de DNA com alta densidade no substrato sólido.