O esgoto gerado pela agroindústria, como o abate de animais e frigoríficos, a indústria de papel e celulose e indústria sucroalcooleira são consideradas biodegradáveis. Podemos afirmar que:

I - A remoção de matéria orgânica presente nestas águas residuárias pode ser feita por processos biológicos, aeróbios e anaeróbios, singulares ou combinados.
II - De acordo com as características do esgoto industrial, os sistemas biológicos podem ser precedidos de unidades de remoção de sólidos e gorduras.
III - Os processos biológicos mais utilizados são lodos ativados e suas variantes, filtros biológicos, lagoas de estabilização e reatores anaeróbios de fluxo ascendente com mantas de lodo.
IV - Para o tratamento de resíduos biodegradáveis ainda podemos utilizar processos de absorção ou adsorção, sistemas de filtração, osmose reversa ou resinas de troca iônica.