Os transtornos do neurodesenvolvimento resultam de alterações no processo esperado de desenvolvimento do sistema nervoso. No caso do transtorno do déficit de atenção/hiperatividade (TDAH), por exemplo, existe um atraso na maturação nervosa, com menor espessamento cortical e prejuízo em funções do córtex frontal, estrutura importante para a atenção e "poda" sináptica. Já no transtorno do espectro do autismo (TEA), parece haver um prejuízo nos processos de "poda" sináptica, resultando em redes neuronais hiperconectadas em regiões associadas com a amígdala.