Utilização de patógenos de plantas daninhas, como nematoides, fungos, bactérias e vírus. É o mais utilizado no controle de plantas daninhas, devido à facilidade de reprodução dos organismos em laboratório; facilidade na aplicação nas plantas daninhas ou no solo; especificidade do patógeno com a planta daninha.

Uso de insetos herbívoros, que reduzirão a área foliar e a capacidade fotossintética da planta daninha, levando à redução da competitividade com a planta cultivada.

Utiliza-se animais que consumirão as sementes antes ou após a dispersão dos diásporos pela planta daninha. Pode-se utilizar besouros, formigas e camundongos.

Utilização de animais domesticados para diminuir o crescimento das plantas daninhas em um local. Pode-se utilizar patos, gansos, ovelhas, cabras e até peixes.