Alimentos estocados em locais onde há temperatura baixa (menor que 15 °C), umidade relativa do ar elevada e anaerobiose propiciam condições ideais para a proliferação do fungo e a produção de aflatoxinas.

Os substratos de eleição para a colonização e produção de aflatoxinas são as forrageiras, como Brachiaria decumbens e Panicum maximum, em períodos de chuva, com temperatura ambiente acima de 25 °C e umidade elevada.

As principais alterações clínicas verificadas em um quadro de aflatoxicose são aquelas relativas principalmente ao comprometimento hepático; no entanto, as aflatoxinas podem também produzir imunossupressão, carcinogenicidade e teratogenicidade.

A pasteurização e a liofilização são importantes processos que permitem a eliminação da toxina no leite e em produtos lácteos, já que esta micotoxina é termolábil.

Quando se constatar a presença da toxina no alimento que será destinado aos animais de criação, é necessário que se proceda o aquecimento deste substrato em temperaturas elevadas, permitindo, assim, a morte do fungo e a eliminação da toxina produzida.