O software de modelagem molecular, como o Phyre2 ou o Swiss-Model, permite prever a estrutura tridimensional de proteínas a partir de suas sequências.

O software de alinhamento de sequências, como o BLAST, é utilizado apenas para identificar sequências semelhantes, não para prever estruturas proteicas.

As ferramentas de análise de expressão gênica, como o Microarray, são usadas exclusivamente para avaliar a quantidade de RNA.

O software de simulação molecular, como o GROMACS, é usado apenas para a modelagem de interações entre pequenas moléculas.

O software de edição de imagens, como o Adobe Photoshop, é utilizado para prever a estrutura tridimensional das proteínas.