Por esta técnica, não é necessário o uso de padrão para identificação prévia de uma substância orgânica.

Duas substâncias orgânicas jamais terão o mesmo RF (índice de retenção).

Este método pode ser utilizado para análises quantitativas através do estabelecimento da área da mancha da amostra por densitometria, comparada a um padrão.

Apenas a mistura de sílica gel e gesso pode ser usada como suporte/fase estacionária em cromatografia em camada delgada.

Substâncias que não absorvem radiação na região do ultravioleta não podem ser analisadas por esta técnica.