Na imunofluorescência direta são encontrados depósitos de IgG e C3 intercelulares ao longo de toda a epiderme.

No penfigo vulgar, a clivagem é suprabasal, enquanto no foliáceo se caracteriza por ser subcórnea.

A citologia das lesões bolhosas revela células acantolíticas e é capaz de diferenciar o penfigo foliáceo do penfigo vulgar.

A caracterização dos isotipos de IgG, através da imunofluorescência direta, revela que a subclasse predominante nos penfigos é a IgG4.