A histopatologia tecidual constitui o melhor meio de confirmação de uma suspeita de FCM.

Bovinos e ovinos tem de interagir ou ficar em pastos comuns para que a doença, seja na forma esporádica ou epidêmica, apareça nos bovinos.

O vírus da FCM ocasiona doença inflamatória multissistêmica e os sinais clínicos resultam de uma vasculite severa em todos os órgãos.

A FCM crônica se caracteriza por um curso clínico longo (geralmente de semanas) de febre alta, lesões erosivas e ulcerativas de mucosa, uveíte bilateral, lesões cutâneas hiperqueratóticas, linfadenopatia e lesões digitais.

A estomatite vesicular, febre aftosa, diarréia viral bovina e língua azul devem ser incluídas no diagnóstico diferencial de febre catarral maligna.