As bactérias Gram-positivas são coradas de violeta, pois a espessa camada de peptideoglicano dessas bactérias fica impregnada de cristal violeta e iodo logo nas primeiras etapas da coloração.

As bactérias Gram-negativas são ricas em peptideoglicano, sendo a camada mais espessa da parede dessas bactérias. Elas se coram de roxo devido à ação da Safranina.

As bactérias Gram-positivas apresentam duas membranas celulares, uma interna e outra externa, além de uma fina camada de peptideoglicano entre as bicamadas lipídicas, sendo coradas de rosa.

As bactérias Gram-negativas são coradas de violeta, pois a espessa camada de peptideoglicano dessas bactérias fica impregnada de cristal violeta e iodo logo nas primeiras etapas da coloração.