Os compostos clorados são menos efetivos do que o ácido acético, encontrado no vinagre. Por isso, devemos sempre imergir os alimentos em solução com vinagre após a limpeza.

Os compostos iodados apresentam uma grande vantagem, que é não serem afetados pela dureza da água, podendo ser utilizado sem redução de eficácia pela concentração de sais.

Como desvantagem os compostos iodados apresentam odor forte e podem manchar algumas superfícies.

Os sanitizantes que contém o ácido peracético podem ser utilizados em substituição aos compostos clorados, pois sua ação é mais ampliada para os diversos tipos de microrganismos.

Os sanitizantes à base de cloro são efetivos contra todos os tipos de microrganismos, mas a desvantagem é que são irritantes a pele.