A Monitoria Sanitária - MS pode ser usada para o diagnóstico de situação. Assim se avalia a situação do(s) rebanho(s) para determinada doença ex: pneumonia enzoótica.

Monitoria de sentinelas usado em programas de erradicação de doenças em granjas. Consiste na introdução de animais livres de um agente mas, suscetíveis a esse determinado agente (animais sentinelas) no local onde vivem a população da qual se quer erradicar a doença. Ex: granjas de melhoramento genético com casos sub-clínicos mas, os animais de grande valor zootécnico não devem ser sacrificados.

A MS pode ser usada para quantificação dos níveis de proteção para determinada doença. Assim como nos outros casos a monitoria só deve ser direcionada aos animais e assim verificar, nos animais, se as medidas tomadas, estão surtindo efeito.

A MS pode ser usada para definição de status de livre para certa doença. Nesse caso a MS é usada para fins comerciais, de pesquisa ou quando se quer erradicar doenças que exercem impactos sobre a produtividade.

Verificação de resultados obtidos após a aplicação de medidas corretivas. A MS verifica os resultados dos programas implantados do uso de quimioterápicos ou imunógenos.