A biodiversidade não é importante em uma agrofloresta, pois ela não permite o equilíbrio do sistema.

Sistema agroflorestal sintrópico busca imitar o que a floresta faz normalmente, deixando o solo sempre coberto pela vegetação, com variedades de plantas trabalhando simultaneamente, ou seja, ajudando umas às outras.

Quando nos referimos à ciclagem de nutrientes em uma agrofloresta, podemos afirmar que ela não mantém o solo rico e fértil.

Em sistema agroflorestal sintrópico não é importante replicar os processos que ocorrem na natureza, compreender o funcionamento do ecossistema original do lugar, criando condições ambientais satisfatórias para o desenvolvimento evolutivo das espécies que ali estão e daqueles que foram inseridas.

Em sistema agroflorestal sintrópico, as árvores não podem ser cultivadas em consórcio com criação animal e(ou) leguminosas.