A atividade microbicida da clorexidina se dá principalmente contra bactérias Gram-positivas e Gram-negativas, assim como contra alguns vírus, como, por exemplo, o do herpes e do HIV, mas não mantém a atividade na presença de sangue.

A descontaminação tem por finalidade diminuir o número de micro-organismos presentes em artigos sujos, sendo indicado o uso de agentes químicos desinfetantes.

Substâncias antissépticas são providas de ação letal ou inibitória da reprodução microbiana. Elas são destinadas a aplicações em pele, mucosas e superfícies, além de serem hipoalérgicas.

A limpeza constitui o núcleo de todas as ações referentes aos cuidados de higiene com produtos hospitalares, devendo sempre preceder os procedimentos de esterilização, mas não os de desinfecção.

A desinfecção é um processo de eliminação ou destruição dos micro-organismos na forma vegetativa. A destruição de bactérias na forma esporulada pode ocorrer, mas não se tem o controle ou a garantia do resultado.