O primeiro passo para programar o MIP é entender o agente causador, ou seja, determinar quem causou determinado sintoma na planta. Por exemplo, uma clorose em folhas (Figura 2) pode ser devida ao ataque de um inseto que se alimenta de seiva, ou uma doença causada por fitopatógeno ou deficiência nutricional ou ação fitotóxica de um herbicida, ou seja, o conhecimento das pragas-chave de uma cultura é fundamental para um programa de MIP.