A base do pedúnculo cerebral se encontra fibras dos tractos cortico-espinhal, cortico-nucleares e cortiço-pontinos.

No tecto do mesencéfalo encontramos estruturas denominadas culículos superiores, que se relacionam com a via visual, e culículos inferiores, que se relacionam com a via auditiva.

No tegmento do pedúnculo cerebral encontramos os núcleos dos nervos óptico, oculomotor, troclear e trigêmeo.

O núcleo do nervo troclear encontra-se ao nível do culículo inferior, dorsalmente ao fascículo longitudinal medial.

O núcleo do oculomotor é dividido em duas porções, sendo uma somática, pertencente ao controle da musculatura de movimentação ocular, e outra visceral, pertencendo ao parassimpático, denominado núcleo de Edinger-Westphal, que controla a dilatação e contração pupilar ao estímulo luminoso.