A poluição não interfere no aumento do número de leveduras. Contudo, as temperaturas acima de 28 °C param sua multiplicação.

A maioria das leveduras crescem em rizosferas, ricas em nutrientes e afastadas das raízes das plantas.

O interesse das leveduras do solo aos alimentos ecológicos é que as mesmas são consideradas fontes de contaminação. Várias espécies de leveduras são típicos habitantes do solo. Contudo, têm espécies que se originam de plantas e animais.

Leveduras realizam várias interações com outros organismos do solo e, também, servem como nutrientes para protozoários e bactérias.