O estudo dos mecanismos básicos de funcionamento possibilita melhorar o uso de fertilizantes, compreender os sintomas de carência, as formas de absorção e as funções de cada elemento na estrutura e no metabolismo das plantas.

A compreensão dos processos fisiológicos de resposta ao estresse abiótico e na interação patógeno x planta e inseto x planta podem ser facilmente identificadas apenas pela observação visual.

Os conhecimentos de fisiologia vegetal contribuem para diversas práticas de interesse agrícola, embora não sejam aplicáveis ao melhoramento vegetal, ao controle de pragas e doenças e na conservação pós-colheita.