Para os efluentes industriais não biodegradáveis com altas concentrações dos poluentes, são indicados processos de absorção ou adsorção, sistemas de filtração, osmose reversa ou resinas de troca iônica.

A relação demanda bioquímica de oxigênio/demanda química de oxigênio (DBO/DQO) é a mais comumente utilizada para verificação do conteúdo orgânico biodegradável.

Em efluentes industriais com compostos tóxicos, após o tratamento biológico, deve haver a remoção desses compostos, com o objetivo de garantir o padrão de lançamento dos efluentes.

Os efluentes industriais não biodegradáveis e tóxicos são caracterizados pelo conteúdo orgânico pouco recalcitrante ou por serem efluentes predominantemente químicos, como os da galvanoplastia.

Na nitrificação, reação mediada por bactérias autotróficas, ocorre a oxidação biológica do nitrato, tendo a amônia como produto final.