O termo Ilha Biogeográfica se refere apenas a uma porção de terra cercada por água por todos os lados.

O termo Ilha Biogeográfica se refere a qualquer biótopo isolado, dentro do qual se desenvolve uma ou mais populações, isoladas de outras. Esse conceito também foi substituído pelo de refúgio.

A teoria da biogeografia de ilhas tem recebido muitas críticas, porque não considera as comunidades dinamicamente e parte do princípio de que o número de espécies é afetado somente pelas características físicas da ilha e não pelas relações biológicas entre elas.

A biota das ilhas não é um conjunto de comunidades individuais, que viviam isoladas umas das outras, mas um sistema dinâmico, integrado, complexo, no qual novas comunidades surgem afastando as antigas.