Para a construção de uma base de dados eficiente, a definição prévia dos objetivos a serem alcançados é importante, a fim de evitar a coleta excessiva ou insuficiente de dados.

Para a elaboração de mapas em um SIG, vários tipos de dados podem ser combinados, tais como, os dados tabulares e os cartográficos.

A alta qualidade dos dados de endereçamento disponíveis nos sistemas de informação em saúde no SUS é um fator que facilita a localização geoespacial dos casos e o uso de um SIG.

Sistemas de informação em saúde, como o e-SUS Notifica e o SIM (Sistema de Informação sobre mortalidade), podem ser utilizados como fonte de dados secundários para a alimentação de um SIG.