As fibras alimentares reduzem a absorção desse mineral por estarem geralmente associadas aos fitatos.

As proteínas reduzem o processo absortivo do magnésio quando a ingestão proteica é inferior a 30 g/dia.

Cerca de 80% do magnésio presente nos cereais podem ser removidos com o refinamento da farinha.

Alguns frutanos, como a inulina, podem aumentar a absorção do magnésio, pois favorecem a atividade de bactérias produtoras de ácidos graxos de cadeia curta, causando redução do pH luminal, aumento da solubilidade e do fluxo sanguíneo e vasodilatação das artérias intestinais, favorecendo assim o aumento da absorção do mineral.

Ingestão elevada de sódio, cálcio e cafeína pode reduzir a excreção renal do magnésio.